Az igazgatóság a jövőképvezérelt nemzetstratégiai közgondolkodás erősítése, a tervezési, értékelési és monitoring rendszer kialakítása, valamint a kiemelt nemzeti integrációs feladatok szakmai koordinációja mellett - döntés előkészítő feladatkörének megfelelően - javaslatokat, háttéranyagokat készít.
A nemzetstratégia és a nemzeti integráció szempontjából kiemelt területeken összehangolja a szakmai szereplők, tudományos műhelyek együttműködését; konferenciákon, műhelyfórumokon és munkacsoportokban konzultál az érintett közösségekkel. Együttműködik a Kárpát-medencei és nemzeti intézményi szakértői, illetve kutatói hálózatokkal, kormányzati szereplőkkel és háttérintézményekkel.
Feladatai között szerepel a nemzeti integrációt szolgáló 2014-2020-as, 2021-2027-es Kárpát-haza Fejlesztési Rendszer kutatói támogatása, a tervezési, értékelési és monitoring-rendszer előkészítése. A nemzetstratégiai és nemzeti integrációs kutatások koordinációja mellett szakmai konferenciákat szervez, gyűjti a jó gyakorlatokat és gondoskodik azok Kárpát-medencei disszeminációjáról.